Der FTP-Client FileZilla ist trotz der umfangreichen Profi-Funktionsausstattung verhältnismäßig einfach zu bedienen. Das mehrfach unterteilte Programmfenster zeigt neben einer lokalen Laufwerksansicht auch das Verzeichnis des gerade verbundenen Servers und die FTP-Kommandos im Klartext. Zu den Hauptfunktionen des Dateiübertragungs-Tools gehört die Wiederaufnahme abgebrochener Up- und Downloads, die Unterstützung von Dateiübertragungen über ein Firewall hinweg und per SSL-Verbindung verschlüsselte Dateitransfers. Eine jederzeit editierbare Warteschlange (Queue) verwaltet die zur Übertragung vorgemerkten Dateien.